在CDM項(xiàng)目審定和注冊以前，項(xiàng)目參與者必須得到所在國DNA的書面批準(zhǔn)。通常，這些國家是指附件一和非附件一國家。但是，一個(gè)CDM項(xiàng)目可以在沒有附件一發(fā)達(dá)國家批準(zhǔn)的情況下，繼續(xù)進(jìn)行CDM項(xiàng)目的注冊，這種項(xiàng)目類型被稱為『單邊CDM項(xiàng)目』。有附件一和非附件一國家共同參與的，稱『雙邊CDM項(xiàng)目』。但這不意味著單邊項(xiàng)目就完全被赦免提交一份附件一國家DNA的批準(zhǔn)文件。當(dāng)一個(gè)單邊項(xiàng)目的開發(fā)者后來找到了附件一國家的CERs購買者，并請求CDM執(zhí)行理事會(huì)把該項(xiàng)目簽發(fā)的CFRs劃撥給買方，CDM執(zhí)行理事會(huì)仍然會(huì)要求得到附件一國家的DNA批準(zhǔn)文件。

       獲得了各國DNA的批準(zhǔn)后，項(xiàng)目參與方應(yīng)該從『指定經(jīng)營實(shí)體』DOEs名單中挑選一家并簽訂服務(wù)合同?！褐付ń?jīng)營實(shí)體』是CDM執(zhí)行理事會(huì)委派和指定的第三方機(jī)構(gòu)，具有審定、核查、核證CDM項(xiàng)目的資格和權(quán)力?！褐付ń?jīng)營實(shí)體』在簽署服務(wù)合同時(shí)，一般要仔細(xì)審閱項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件和其他資料，以確認(rèn)項(xiàng)目是否滿足了CDM的有關(guān)要求，并建立和公布一個(gè)網(wǎng)址，使得項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件PDD可連接到UNFCCC的CDM網(wǎng)站，或者直接在UNF CCC的CDM網(wǎng)站上公布項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件。PDD網(wǎng)上公布的30天內(nèi)，對收到的各利益相關(guān)方、有授權(quán)的非政府機(jī)構(gòu)等的各種評價(jià)，應(yīng)及時(shí)地予以承認(rèn)和公示所有評價(jià)的內(nèi)容、解釋、說明及評論者的聯(lián)系方式等。如果審定階段中，項(xiàng)目參與方希望改變所用的已批準(zhǔn)方法學(xué)，或改變所適用方法學(xué)的版本，『指定經(jīng)營實(shí)體』必須把有關(guān)內(nèi)容公布于網(wǎng)站上30天。

       項(xiàng)目的注冊是『指定經(jīng)營機(jī)構(gòu)』在完成審定CDM項(xiàng)目的合格性之后，使用『CDM項(xiàng)目活動(dòng)注冊和審定報(bào)表』、項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件、東道國書面批復(fù)和有關(guān)評價(jià)問題的解釋等資料，準(zhǔn)備好審定報(bào)告。然后使用UNFCCC秘書處提供的基于互聯(lián)網(wǎng)的電子文件提交工具，向秘書處傳遞項(xiàng)目注冊的申請。提交了所有文件信息后，『指定經(jīng)營實(shí)體』會(huì)自動(dòng)收到一個(gè)唯一的編號，可用來確認(rèn)注冊費(fèi)的轉(zhuǎn)賬情況和查詢注冊審批的進(jìn)展。秘書處將決定DOE提交的有關(guān)項(xiàng)目注冊的所有文件和信息是否齊全。在注冊費(fèi)先行繳納和秘書處發(fā)出關(guān)于申請注冊文件齊全的確認(rèn)之后，『項(xiàng)目注冊的申請』就算是正式開始并在UNFCCC的CDM網(wǎng)站上公示至少8個(gè)星期。

       在注冊環(huán)節(jié)中，項(xiàng)目參與方需繳納注冊費(fèi)。注冊費(fèi)是作為CDM行政管理費(fèi)用收益分配的一部分應(yīng)繳款來收取的，具體金額則按照項(xiàng)目活動(dòng)計(jì)入期內(nèi)預(yù)計(jì)每年的減排量來計(jì)算的。每年15000噸二氧化碳當(dāng)量內(nèi)的CERs需交納0.10美元/CER；超出15,000噸以上的部分按0.20美元/CER收取。無論多大的項(xiàng)目，注冊費(fèi)的總額均不超過350,000美元。每年預(yù)計(jì)減排量低于15,000噸二氧化碳當(dāng)量的項(xiàng)目活動(dòng)不需要交納注冊費(fèi)。